Aukštąjį išsilavinimą Panevėžio apskrityje teikia dvi mokyklos - Kauno technologijos universiteto Panevėžio institutas (KTU Panevėžio institutas) ir Panevėžio kolegija (PK). KTU Panevėžio instituto Technologijų ir vadybos ir Administravimo fakultetuose galima mokytis pagal 6 bakalauro ir 3 magistro studijų programas: automatika ir valdymas, mechanikos inžinerija, statybos inžinerija, transporto priemonių inžinerija, valdymo inžinerija, verslo administravimas, vadyba. 2007-2008 m. m. KTU Panevėžio institute studijuoja 1718 studentų (2006 m. - 1906 studentai). Pagrindinė KTU Panevėžio instituto problema - nedidelis mokslinius laipsnius bei pedagoginius vardus turinčių dėstytojų skaičius. Tai viena iš svarbiausių kliūčių siekiant įsteigti savarankišką regioninį universitetą.

        2002 metais sujungus tris apskrities aukštesniąsias mokyklas įsteigta Panevėžio kolegija – neuniversitetinė aukštoji mokykla. 2002-2006 m. PK studentų skaičius padaugėjo nuo 1683 iki 2344. 2007-2008 m. m. šioje aukštojoje mokykloje mokosi 2265 studentai. Jie studijuoja dviejuose fakultetuose ir Rokiškio filiale pagal įvairias programas: 
            ● Verslo ir technologijų fakultetas: aplinkos apsauga, elektros ir automatikos įrenginiai, statyba, kompiuterių technika, informacinės sistemos, buhalterinė apskaita, verslo vadyba.
            ● Sveikatos, socialinės priežiūros ir edukologijos fakultetas: bendrosios praktikos slauga, kineziterapija, odontologinė priežiūra, burnos higiena, socialinis darbas, socialinė pedagogika, užimtumo administravimas, pradinio ugdymo pedagogika, ikimokyklinio ugdymo pedagogika, dailės ir technologijų pedagogika, pramoginė muzika, muzikos pedagogika.
            ● Rokiškio filialas: kultūrinės veiklos vadyba, anglų ir vokiečių kalbų pedagogika, muzikos pedagogika.

        2007-2008 m. m. apskrityje vaikai lankė 53 lopšelius-darželius (darželius) ir ugdėsi 133 bendrojo lavinimo mokyklose: 5 pradinėse, 13 mokyklų darželių, 60 pagrindinių, 3 jaunimo, 38 vidurinėse mokyklose ir 14 gimnazijų. Įgyvendinant savivaldybių mokyklų tinklo pertvarkos bendruosius planus, apskrityje mažėja pradinių, pagrindinių, vidurinių mokyklų. Per pastaruosius dvejus metus netekome 9 bendrojo lavinimo mokyklų. Dėl vykdomos vidurinio ugdymo programos akreditacijos gimnazijų skaičius išaugo nuo 10 iki 15. 2007-2008 m. m. bendrojo lavinimo mokyklose ugdomi 45247 mokiniai (6819 mokinių mažiau negu 2004-2005 m. m.). Bendrojo lavinimo mokyklose 2007-2008 m. m. ugdomi 5926 specialiųjų poreikių mokiniai. Specialiąją pagalbą jiems teikia 95 specialistai (62 specialiųjų poreikių mokiniai tenka vienam specialistui).

        2006-2007 m. m. brandos atestatus gavo 2697 abiturientai. 86,7 proc. baigusių vidurines mokyklas ir gimnazijas tęsia mokymąsi profesinėse mokyklose, kolegijose ir universitetuose (šalies vidurkis 81 proc.).

        Apskrities viršininko pavaldume 2007-2008 m. m. buvo šešios švietimo įstaigos - Panevėžio Vytauto Mikalausko menų mokykla, teikianti pagilintą meninį ugdymą apskrities gyventojų vaikams, trys specialiosios mokyklos, vienas specialiojo ugdymo centras, suaugusiųjų bendrojo lavinimo vidurinė mokykla Panevėžio pataisos namuose. Apskrities specialiosiose mokyklose 2007-2008 mokslo metais mokosi 789 mokiniai. Iš jų 255 specialiosiose mokyklose (centre) su protine negalia (136 lavinamosiose ir 119 specialiosiose klasėse) ir 52 su klausos negalia. Specialiųjų poreikių vaikams integruojantis į apskrities bendrojo lavinimo mokyklas, mažėja mokinių specialiosiose mokyklose (centre). Lyginant su 2006-2007 m. m. mokinių skaičius specialiosiose mokyklose sumažėjo 13 mokinių (5 proc.). Apskrities viršininkui pavaldžiose mokyklose dirba 83 proc. atestuotų pedagogų ir 70 proc. atestuotų vadovų.

        Vykdant pedagogų kvalifikacijos tobulinimo sistemos decentralizaciją, savivaldybėse kūrėsi pedagogų švietimo centrai (skyriai). Per pastaruosius septynerius metus jų skaičius išaugo nuo dviejų iki penkių, o 2007 m. švietimo centrą įsteigė ir mažiausia apskrityje Kupiškio rajono savivaldybė.

        Siekiant priartinti specialiosios pagalbos teikimą prie paslaugų vartotojų, pedagoginės psichologinės tarnybos įsteigtos visose apskrities savivaldybėse. Jų paslaugomis naudojasi ir apskrities viršininkui pavaldžių mokyklų, ir vaikų globos namų mokiniai ir pedagogai. Apskrities viršininkui pavaldžių švietimo įstaigų 2007 metų biudžetas lyginant su 2006 metais padidėjo 158,1 tūkst. litų dėl mokinio krepšelio lėšų ir darbo užmokesčio didinimo. Padidėjo ir vienam mokiniui tenkanti ugdymui ir ūkiui skirtų lėšų suma iki 1603 Lt. 2007-2008 m. m. specialiosiose mokyklose sukomplektuoti 43 klasių komplektai. Vidutiniškai klasės komplekte yra 7,1 mokinio. 2006 m. vidutiniškai klasės komplekte buvo 7,3 mokinio. Apskrities savivaldybės švietimui vidutiniškai skiria 52,6 proc. bendro biudžeto lėšų (skiriamos lėšos kinta nuo 49,3 proc. iki 58,9 proc.), tačiau jų nepakanka pedagoginei ir psichologinei pagalbai teikti bendrojo lavinimo ir specialiosiose mokyklose.